加盟商和代理商还是有本质上的区别的，这里用实体休闲食品店为例，具体区别如下：

首先谈下加盟商。实体休食加盟店店属于企业的连锁店，一般由投资人全资建店并负责经营。营业执照是投资人的公司，但品牌被授权使用。无论门头还是内部装修，都遵循企业标准和要求。也就是说，所有加盟店都被企业授权使用同一品牌名称，并且内外形象统一。店内产品均为企业生产的产品，没有其他品牌的。

不同的企业，对于加盟商的支持程度也不同。做的好的企业，产品会随着市场需求变化而更新及时加盟商协议，定期对加盟商进行有目的指导和培训，以适应经营需求。还会有效的培养品牌知名度和口碑以促进连锁店整体的发展。通俗比喻，如果直营店是直系亲属，那么加盟店就是走的近的亲戚，都是属于大家族一员。加盟店优点是借助品牌力量吸引顾客，属于正规军，有靠山。缺点是有时候不够灵活，管理上受限制。

其次谈下代理商。与加盟商不同的是，代理商开的休食店用自己起的名字，自己负责选址、找房并按照自己意愿装修。店内经营的产品由经营者自由选择，可以卖任意品牌产品，有些产品直接从批发市场采购，有一些需要需要和相关企业签订代理协议，进货售卖。可以同时代理多个品牌产品，没有约束。代理商的优势是比较灵活，相对自由，总体成本也低。缺点是没有品牌优势，不容易引流吸引顾客，没有指导全靠自身力量。

总得来说，加盟商和代理商区别还是比较大的，选择什么样的模式加盟商协议，主要还是看投资者个人情况而定。